Conforme recomendação dos órgãos de saneamento, as limpezas dos reservatórios devem ser feitas periodicamente, pelo menos a cada 6 meses.
A higienização é feita através de escovação, lavagem das paredes e sucção dos rejeitos, visando a completa remoção do material impregnado como fungos, bactérias, algas, vírus, protozoários e outros microrganismos que podem contaminar a água. É muito importante manter a vedação dos reservatórios com tampas adequadas que impeça o contato com o meio externo.
Recomenda-se o fechamento dos registros antes da execução dos serviços, a fim de evitar desperdício de água potável.